النواقل العصبية توجد بشكل رئيسي في الجهاز العصبي المركزي.
والذي يشمل الدماغ والحبل الشوكي. تُفرز النواقل العصبية من نهايات الأعصاب عند التشابكات العصبية، وهي نقاط الاتصال بين الخلايا العصبية. بمجرد إفرازها، تنتقل النواقل العصبية عبر الشق التشابكي لتصل إلى مستقبلات على سطح الخلية العصبية المجاورة، حيث تقوم بنقل الإشارة.
بعض النواقل العصبية، مثل السيروتونين والدوبامين، توجد في مناطق معينة من الدماغ. على سبيل المثال، يُصنع السيروتونين بشكل رئيسي في نوى الرابيه (Raphe nuclei) في الدماغ المتوسط، بينما يُصنع الدوبامين في مناطق مثل المادة السوداء (Substantia nigra) والمنطقة السقيفية البطنية (Ventral tegmental area).